嘉兴在1983年撤地建市时，将原嘉兴县分设为城区、郊区，1999年6月，郊区更名时将古秀州的“州”字上加了三点水，称为秀洲区。

秀洲区的前身是嘉兴县，始建于春秋时期。

1983年嘉兴撤地建市，把原嘉兴县农村部分建立为嘉兴市郊区，1999年更名为秀洲区，2000年嘉兴市对市本级实施行政区划调整，形成城有乡的行政区域范。